MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Escherichia coli O104:H4 str. 2011C-3493 plasmid pAA-EA11

Total Repeats: 1494

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018666	CAC	2	6	28	33	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_018666	AGCAAG	2	12	87	98	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_018666	TTC	2	6	106	111	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_018666	GCT	2	6	121	126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_018666	TCA	2	6	161	166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_018666	AAT	2	6	231	236	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018666	GCT	2	6	271	276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_018666	T	6	6	327	332	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018666	CAAGAT	2	12	385	396	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_018666	TC	3	6	399	404	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_018666	AT	3	6	418	423	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018666	TTG	2	6	469	474	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018666	GTTT	2	8	488	495	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018666	TTC	2	6	505	510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_018666	AT	3	6	571	576	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018666	TTC	2	6	635	640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_018666	TCATT	2	10	654	663	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_018666	T	6	6	682	687	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018666	TTC	2	6	725	730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_018666	TC	3	6	766	771	0 %	50 %	0 %	50 %	407484806
21	NC_018666	CAG	2	6	847	852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407484806
22	NC_018666	TGA	2	6	891	896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407484806
23	NC_018666	TGC	2	6	977	982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407484806
24	NC_018666	CTC	2	6	1045	1050	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407484806
25	NC_018666	CTC	2	6	1096	1101	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407484806
26	NC_018666	GGT	2	6	1150	1155	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407484806
27	NC_018666	TGC	2	6	1262	1267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407484806
28	NC_018666	ATG	2	6	1298	1303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407484806
29	NC_018666	CCA	2	6	1311	1316	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407484806
30	NC_018666	TCA	2	6	1329	1334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407484806
31	NC_018666	GCCA	2	8	1349	1356	25 %	0 %	25 %	50 %	407484806
32	NC_018666	TGC	2	6	1394	1399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407484806
33	NC_018666	ATG	2	6	1421	1426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407484806
34	NC_018666	GTG	2	6	1427	1432	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407484806
35	NC_018666	TGC	2	6	1535	1540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407484806
36	NC_018666	GCA	2	6	1554	1559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407484806
37	NC_018666	ATG	2	6	1736	1741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407484806
38	NC_018666	ATG	2	6	1769	1774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407484807
39	NC_018666	CCTT	2	8	1800	1807	0 %	50 %	0 %	50 %	407484807
40	NC_018666	ATT	3	9	1819	1827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407484807
41	NC_018666	TAT	2	6	1879	1884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018666	ATA	2	6	1888	1893	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018666	AT	3	6	1938	1943	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018666	T	6	6	1951	1956	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018666	TAT	2	6	1974	1979	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018666	CCT	2	6	1985	1990	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_018666	AGG	2	6	1994	1999	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018666	GGC	2	6	2000	2005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_018666	ATT	2	6	2037	2042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018666	TA	3	6	2061	2066	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018666	AG	3	6	2081	2086	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018666	A	7	7	2097	2103	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018666	GGT	2	6	2157	2162	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018666	GTAT	2	8	2247	2254	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018666	G	6	6	2281	2286	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018666	TGTC	2	8	2287	2294	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_018666	TAT	2	6	2307	2312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018666	CAA	2	6	2323	2328	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_018666	GTT	2	6	2343	2348	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018666	ATA	2	6	2441	2446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018666	TCTAGC	2	12	2447	2458	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_018666	TGAT	2	8	2518	2525	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018666	ACC	2	6	2591	2596	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_018666	ATC	2	6	2660	2665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_018666	ATA	2	6	2681	2686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018666	GGA	2	6	2706	2711	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018666	TCG	2	6	2735	2740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_018666	CCAC	2	8	2755	2762	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
69	NC_018666	TG	3	6	2919	2924	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018666	ATAC	2	8	2935	2942	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_018666	ATG	2	6	3081	3086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018666	GAGTA	2	10	3119	3128	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018666	CTC	2	6	3163	3168	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_018666	GCC	2	6	3303	3308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407484808
75	NC_018666	CTT	2	6	3319	3324	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407484808
76	NC_018666	CCA	2	6	3333	3338	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407484808
77	NC_018666	CGC	2	6	3354	3359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407484808
78	NC_018666	ACC	3	9	3429	3437	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407484808
79	NC_018666	TCA	2	6	3438	3443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407484808
80	NC_018666	GCCA	2	8	3473	3480	25 %	0 %	25 %	50 %	407484808
81	NC_018666	ACACG	2	10	3498	3507	40 %	0 %	20 %	40 %	407484808
82	NC_018666	GTT	2	6	3585	3590	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407484808
83	NC_018666	GCG	2	6	3647	3652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407484808
84	NC_018666	CTC	2	6	3826	3831	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407484808
85	NC_018666	ATC	2	6	3880	3885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407484808
86	NC_018666	CCG	2	6	3936	3941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407484808
87	NC_018666	ACC	2	6	3975	3980	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407484808
88	NC_018666	ATG	2	6	4043	4048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407484808
89	NC_018666	ATA	2	6	4053	4058	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407484808
90	NC_018666	GCG	2	6	4059	4064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407484808
91	NC_018666	GCC	2	6	4097	4102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407484808
92	NC_018666	CAG	2	6	4147	4152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407484808
93	NC_018666	GCG	2	6	4180	4185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407484808
94	NC_018666	TCA	2	6	4194	4199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407484808
95	NC_018666	GAT	2	6	4206	4211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407484808
96	NC_018666	GTG	2	6	4309	4314	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407484808
97	NC_018666	TTGTT	2	10	4557	4566	0 %	80 %	20 %	0 %	407484808
98	NC_018666	TGA	2	6	4600	4605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407484808
99	NC_018666	CGC	2	6	4618	4623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407484808
100	NC_018666	CAGC	2	8	4626	4633	25 %	0 %	25 %	50 %	407484808
101	NC_018666	GCA	2	6	4656	4661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407484808
102	NC_018666	ACT	2	6	4825	4830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_018666	GCCA	2	8	4842	4849	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
104	NC_018666	CCTG	2	8	4905	4912	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
105	NC_018666	GAG	2	6	4927	4932	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018666	CTTG	2	8	4955	4962	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
107	NC_018666	GCT	2	6	5003	5008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_018666	CGAC	2	8	5043	5050	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
109	NC_018666	TCC	2	6	5074	5079	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_018666	GTG	2	6	5107	5112	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018666	TTC	2	6	5151	5156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_018666	ATC	2	6	5182	5187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_018666	TTG	2	6	5296	5301	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018666	CAGA	2	8	5335	5342	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
115	NC_018666	GCCC	2	8	5367	5374	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
116	NC_018666	GTAA	2	8	5392	5399	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018666	CCAC	2	8	5406	5413	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
118	NC_018666	AAC	2	6	5582	5587	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_018666	TCTT	2	8	5648	5655	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_018666	TGC	2	6	5669	5674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_018666	GAT	2	6	5697	5702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018666	CAG	2	6	5794	5799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_018666	CAT	2	6	5803	5808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407484809
124	NC_018666	T	6	6	5808	5813	0 %	100 %	0 %	0 %	407484809
125	NC_018666	CTC	2	6	5829	5834	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407484809
126	NC_018666	GCG	2	6	5877	5882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407484809
127	NC_018666	GGT	2	6	5931	5936	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407484809
128	NC_018666	ATT	2	6	6231	6236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018666	TTC	2	6	6254	6259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_018666	GC	3	6	6330	6335	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
131	NC_018666	TAT	2	6	6344	6349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018666	GCC	2	6	6359	6364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_018666	GGC	2	6	6394	6399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_018666	TGT	3	9	6469	6477	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018666	CAG	2	6	6498	6503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_018666	GAT	2	6	6578	6583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_018666	ATAA	2	8	6694	6701	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018666	TAA	2	6	6757	6762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018666	T	6	6	6845	6850	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_018666	AAAAC	2	10	6873	6882	80 %	0 %	0 %	20 %	407484810
141	NC_018666	TA	3	6	6938	6943	50 %	50 %	0 %	0 %	407484810
142	NC_018666	GAAG	2	8	6976	6983	50 %	0 %	50 %	0 %	407484810
143	NC_018666	GA	3	6	7018	7023	50 %	0 %	50 %	0 %	407484810
144	NC_018666	AATA	2	8	7026	7033	75 %	25 %	0 %	0 %	407484810
145	NC_018666	AGA	2	6	7052	7057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407484810
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149	NC_018666	ATG	2	6	7247	7252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407484810
150	NC_018666	AT	3	6	7276	7281	50 %	50 %	0 %	0 %	407484810
151	NC_018666	ACA	2	6	7301	7306	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407484810
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158	NC_018666	GTCA	2	8	7794	7801	25 %	25 %	25 %	25 %	407484811
159	NC_018666	GT	3	6	7869	7874	0 %	50 %	50 %	0 %	407484811
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169	NC_018666	TGA	2	6	8248	8253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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172	NC_018666	TCA	2	6	8328	8333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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232	NC_018666	ATG	2	6	11058	11063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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270	NC_018666	TAAA	2	8	12737	12744	75 %	25 %	0 %	0 %	407484818
271	NC_018666	AAT	2	6	12787	12792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407484818
272	NC_018666	A	6	6	12848	12853	100 %	0 %	0 %	0 %	407484818
273	NC_018666	TAAT	2	8	12886	12893	50 %	50 %	0 %	0 %	407484818
274	NC_018666	ACG	2	6	12918	12923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407484818
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276	NC_018666	TTA	2	6	12963	12968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
277	NC_018666	TA	3	6	12982	12987	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
278	NC_018666	A	6	6	13007	13012	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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281	NC_018666	ATT	2	6	13065	13070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
282	NC_018666	CTG	2	6	13146	13151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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285	NC_018666	CCG	2	6	13294	13299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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409	NC_018666	TAA	2	6	19451	19456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407484829
410	NC_018666	GCCA	2	8	19523	19530	25 %	0 %	25 %	50 %	407484829
411	NC_018666	GCA	2	6	19558	19563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407484829
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451	NC_018666	ATGT	2	8	21536	21543	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
452	NC_018666	TAT	2	6	21582	21587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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491	NC_018666	GA	3	6	23294	23299	50 %	0 %	50 %	0 %	407484832
492	NC_018666	T	6	6	23306	23311	0 %	100 %	0 %	0 %	407484832
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